分子進化の時空間変動モデル
統計科学セミナー
開催期間
2010.9.30(木)
16:00 ~ 17:00
16:00 ~ 17:00
場所
伊都キャンパス 伊都図書館3階 中セミナー室4
講演者
岸野 洋久 (東大 農学生命科学研究科)
概要
*いつもと曜日が異なりますのでご注意下さい.
生物の適応進化は、集団の中に蓄積されるゲノム上の突然変異と、そ れらにかかる環境による淘汰圧に支えられています。分子進化のプロセスはマル コ フ過程に 従うとみなすことができます。遺伝子配列の種内変異、種間変異か ら、生物の系統関係や淘汰圧の強さと不均質性を評価することができます。相同 なサ イトの尤 度はマルコフ過程の推移確率行列の関数として表現されます。本 講演では分子進化と種分化の時空間統計に焦点を絞り、階層ベイズモデルを中心 とし て、分子進 化速度の時間変動、ウィルスゲノムの組換え、タンパク質にか かる多様化圧の時空間変動を推定する方法を紹介します。